Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MCF2LO15068 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms