Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IKBKBO14920 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms