Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAFD1O14545 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAFD1O14545 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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