Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TAF4O00268 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF4O00268 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF4O00268 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF4O00268 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TAF4O00268 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TAF4O00268 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms