Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2K7ER74 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2K7ER74 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms