Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
J3QW42 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
J3QW42 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
J3QW42 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
J3QW42 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
J3QW42 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
J3QW42 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
J3QW42 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
J3QW42 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms