Protein–RNA interactions for Protein: H7C1H1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1H1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H7C1H1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H7C1H1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H7C1H1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H7C1H1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H7C1H1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H7C1H1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H7C1H1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H7C1H1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H7C1H1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms