Protein–RNA interactions for Protein: A8K0S8

MEIS3P2, Putative homeobox protein Meis3-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P2A8K0S8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MEIS3P2A8K0S8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MEIS3P2A8K0S8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms