Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRRM3A6NNA2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms