Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
STRCP1A6NGW2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
STRCP1A6NGW2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms