Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
SSPOA2VEC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
SSPOA2VEC9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms