Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC66A2RUB6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC66A2RUB6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms