Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTPDC1A2A3K4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPDC1A2A3K4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms