Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLRN2A0PK11 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CLRN2A0PK11 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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