Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWU9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YWU9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
A0A0J9YWU9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.02■□□□□ -0
A0A0J9YWU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YWU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
A0A0J9YWU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms