Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N6

LAMC3, Laminin subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC3Q9Y6N6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC47.79■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC47.79■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC47.78■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC47.77■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.24
LAMC3Q9Y6N6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC47.75■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.7■■■■■ 5.23
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.66■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.66■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC47.65■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
LAMC3Q9Y6N6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
LAMC3Q9Y6N6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
LAMC3Q9Y6N6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC47.61■■■■■ 5.21
LAMC3Q9Y6N6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC47.59■■■■■ 5.21
LAMC3Q9Y6N6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
LAMC3Q9Y6N6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC47.55■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.51■■■■■ 5.2
LAMC3Q9Y6N6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.46■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC47.46■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC47.45■■■■■ 5.19
LAMC3Q9Y6N6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC47.41■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
LAMC3Q9Y6N6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
LAMC3Q9Y6N6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC47.28■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.16
LAMC3Q9Y6N6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC47.24■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC47.24■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC47.24■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.21■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
LAMC3Q9Y6N6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC47.19■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.17■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.16■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.15■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC47.14■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC47.14■■■■■ 5.14
LAMC3Q9Y6N6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
LAMC3Q9Y6N6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
LAMC3Q9Y6N6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
LAMC3Q9Y6N6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
LAMC3Q9Y6N6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC47.06■■■■■ 5.12
LAMC3Q9Y6N6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms