Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PCDHB2Q9Y5E7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PCDHB2Q9Y5E7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PCDHB2Q9Y5E7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PCDHB2Q9Y5E7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PCDHB2Q9Y5E7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCDHB2Q9Y5E7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms