Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCA2Q9UQC9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCA2Q9UQC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLCA2Q9UQC9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLCA2Q9UQC9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLCA2Q9UQC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLCA2Q9UQC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLCA2Q9UQC9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms