Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ53

MGAT4B, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4BQ9UQ53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MGAT4BQ9UQ53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MGAT4BQ9UQ53 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MGAT4BQ9UQ53 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MGAT4BQ9UQ53 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MGAT4BQ9UQ53 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MGAT4BQ9UQ53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MGAT4BQ9UQ53 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms