Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD4Q9ULV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD4Q9ULV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FZD4Q9ULV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FZD4Q9ULV1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FZD4Q9ULV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FZD4Q9ULV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD4Q9ULV1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms