Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTI1BQ9UEU0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTI1BQ9UEU0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VTI1BQ9UEU0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VTI1BQ9UEU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VTI1BQ9UEU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VTI1BQ9UEU0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms