Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNAJB4Q9UDY4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DNAJB4Q9UDY4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DNAJB4Q9UDY4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DNAJB4Q9UDY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DNAJB4Q9UDY4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DNAJB4Q9UDY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DNAJB4Q9UDY4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DNAJB4Q9UDY4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DNAJB4Q9UDY4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms