Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF7Q9UBF6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF7Q9UBF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF7Q9UBF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF7Q9UBF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RNF7Q9UBF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RNF7Q9UBF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms