Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
COPG2Q9UBF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COPG2Q9UBF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COPG2Q9UBF2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COPG2Q9UBF2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
COPG2Q9UBF2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COPG2Q9UBF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COPG2Q9UBF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COPG2Q9UBF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms