Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GCNT4Q9P109 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GCNT4Q9P109 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GCNT4Q9P109 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GCNT4Q9P109 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GCNT4Q9P109 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GCNT4Q9P109 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GCNT4Q9P109 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms