Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HMG20BQ9P0W2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMG20BQ9P0W2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HMG20BQ9P0W2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
HMG20BQ9P0W2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
HMG20BQ9P0W2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HMG20BQ9P0W2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
HMG20BQ9P0W2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
HMG20BQ9P0W2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms