Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM3

ITSN2, Intersectin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN2Q9NZM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ITSN2Q9NZM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.44■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
ITSN2Q9NZM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
ITSN2Q9NZM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
ITSN2Q9NZM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.23■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
ITSN2Q9NZM3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
ITSN2Q9NZM3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
ITSN2Q9NZM3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ITSN2Q9NZM3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.01■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
ITSN2Q9NZM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
ITSN2Q9NZM3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
ITSN2Q9NZM3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
ITSN2Q9NZM3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ITSN2Q9NZM3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms