Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CMTM6Q9NX76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CMTM6Q9NX76 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CMTM6Q9NX76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CMTM6Q9NX76 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CMTM6Q9NX76 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CMTM6Q9NX76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CMTM6Q9NX76 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CMTM6Q9NX76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTM6Q9NX76 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CMTM6Q9NX76 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms