Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS2

MRPS18A, 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18AQ9NVS2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPS18AQ9NVS2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPS18AQ9NVS2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPS18AQ9NVS2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MRPS18AQ9NVS2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MRPS18AQ9NVS2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRPS18AQ9NVS2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MRPS18AQ9NVS2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPS18AQ9NVS2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MRPS18AQ9NVS2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS18AQ9NVS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS18AQ9NVS2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS18AQ9NVS2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms