Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HPS4Q9NQG7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HPS4Q9NQG7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HPS4Q9NQG7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HPS4Q9NQG7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HPS4Q9NQG7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HPS4Q9NQG7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HPS4Q9NQG7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HPS4Q9NQG7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms