Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HINT3Q9NQE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HINT3Q9NQE9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HINT3Q9NQE9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HINT3Q9NQE9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HINT3Q9NQE9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HINT3Q9NQE9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HINT3Q9NQE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms