Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MEPEQ9NQ76 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MEPEQ9NQ76 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MEPEQ9NQ76 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MEPEQ9NQ76 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MEPEQ9NQ76 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MEPEQ9NQ76 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MEPEQ9NQ76 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MEPEQ9NQ76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEPEQ9NQ76 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MEPEQ9NQ76 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MEPEQ9NQ76 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MEPEQ9NQ76 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms