Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH5

NOX4, NADPH oxidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOX4Q9NPH5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOX4Q9NPH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOX4Q9NPH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NOX4Q9NPH5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NOX4Q9NPH5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NOX4Q9NPH5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOX4Q9NPH5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms