Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FZD3Q9NPG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FZD3Q9NPG1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FZD3Q9NPG1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FZD3Q9NPG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD3Q9NPG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FZD3Q9NPG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FZD3Q9NPG1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms