Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK1

ZDBF2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDBF2Q9HCK1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ZDBF2Q9HCK1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZDBF2Q9HCK1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ZDBF2Q9HCK1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZDBF2Q9HCK1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZDBF2Q9HCK1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ZDBF2Q9HCK1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZDBF2Q9HCK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZDBF2Q9HCK1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZDBF2Q9HCK1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZDBF2Q9HCK1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZDBF2Q9HCK1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.7 ms