Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCE7

SMURF1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1Q9HCE7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SMURF1Q9HCE7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SMURF1Q9HCE7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMURF1Q9HCE7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMURF1Q9HCE7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMURF1Q9HCE7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMURF1Q9HCE7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms