Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RIBC2Q9H4K1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RIBC2Q9H4K1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RIBC2Q9H4K1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIBC2Q9H4K1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC2Q9H4K1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIBC2Q9H4K1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC2Q9H4K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms