Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 320.5■□□□□ 0.877e-9■■■■■ 38.1
CSTF2TQ9H0L4 SUN1-201ENST00000340926 2128 ntTSL 513.22□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 38
CSTF2TQ9H0L4 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 38
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-209ENST00000524525 548 ntTSL 418.75■□□□□ 0.597e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-211ENST00000528944 866 ntTSL 516.18■□□□□ 0.187e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-212ENST00000532574 492 ntTSL 215.92■□□□□ 0.147e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-202ENST00000460277 1955 ntTSL 1 (best)15.19■□□□□ 0.027e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-201ENST00000313835 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.87e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.367e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.477e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 GPR89A-205ENST00000466593 919 ntTSL 55.77□□□□□ -1.497e-11■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-207ENST00000472453 1764 ntTSL 1 (best)22.86■■□□□ 1.251e-10■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-10■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-10■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-7■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 LINC00482-202ENST00000577000 461 ntTSL 313□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 37.9
CSTF2TQ9H0L4 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.822e-11■■■■■ 37.7
CSTF2TQ9H0L4 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 37.7
CSTF2TQ9H0L4 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 37.7
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-206ENST00000572789 1006 ntTSL 217.22■□□□□ 0.354e-11■■■■■ 37.7
CSTF2TQ9H0L4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.69e-8■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 518.38■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ATF1-204ENST00000552487 745 ntTSL 510.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ATF1-203ENST00000551831 970 ntTSL 26.51□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ATF1-205ENST00000552510 549 ntTSL 56.1□□□□□ -1.431e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 POLR2H-209ENST00000460083 439 ntTSL 315.08■□□□□ 04e-8■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.061e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.461e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.61e-9■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 ENTPD2-203ENST00000460614 1427 ntTSL 1 (best)16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 37.6
CSTF2TQ9H0L4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.42e-26■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 49.57□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-205ENST00000424913 592 ntTSL 48.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-211ENST00000437738 565 ntTSL 56.91□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-231ENST00000637137 107 ntTSL 56.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 56.57□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 46.55□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 56.52□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.112e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 TBL1XR1-229ENST00000636912 100 ntTSL 50.04□□□□□ -2.42e-7■■■■■ 37.5
CSTF2TQ9H0L4 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.519e-10■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.779e-10■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 TNFAIP3-201ENST00000237289 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-9■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 TNFAIP3-208ENST00000615468 3818 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-9■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.92e-9■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.179e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.129e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.239e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.339e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.379e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.419e-11■■■■■ 37.4
CSTF2TQ9H0L4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.925e-23■■■■■ 37.3
CSTF2TQ9H0L4 ZNF707-212ENST00000527561 1252 ntTSL 215.01□□□□□ -0.015e-23■■■■■ 37.3
CSTF2TQ9H0L4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 37.3
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 516.79■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-207ENST00000475100 919 ntTSL 315.69■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-206ENST00000472113 1414 ntTSL 514.43□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-212ENST00000485189 797 ntTSL 314.24□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-209ENST00000477690 1220 ntTSL 313.41□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 513.25□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-10■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 517.39■□□□□ 0.372e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.262e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.382e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-11■■■■■ 37.1
CSTF2TQ9H0L4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 215.7■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 214.67□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 ABT1-201ENST00000274849 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.824e-11■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 DAZAP1-208ENST00000589874 3642 nt13□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-215ENST00000498592 707 ntTSL 317.89■□□□□ 0.453e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-212ENST00000491767 787 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-202ENST00000359117 2222 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-213ENST00000495452 742 ntTSL 37.7□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-214ENST00000497004 3048 ntTSL 1 (best)7.53□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 37
CSTF2TQ9H0L4 MLF1-211ENST00000487838 473 ntTSL 27.44□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 37
Retrieved 100 of 19,151 protein–RNA pairs in 229.7 ms