Protein–RNA interactions for Protein: Q9C056

NKX6-2, Homeobox protein Nkx-6.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-2Q9C056 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NKX6-2Q9C056 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NKX6-2Q9C056 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NKX6-2Q9C056 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NKX6-2Q9C056 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKX6-2Q9C056 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NKX6-2Q9C056 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms