Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMUB1Q9BVT8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMUB1Q9BVT8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMUB1Q9BVT8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMUB1Q9BVT8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMUB1Q9BVT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms