Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUV0

RSRP1, Arginine/serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSRP1Q9BUV0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RSRP1Q9BUV0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RSRP1Q9BUV0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RSRP1Q9BUV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RSRP1Q9BUV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RSRP1Q9BUV0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms