Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM79Q9BSE2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM79Q9BSE2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM79Q9BSE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM79Q9BSE2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM79Q9BSE2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM79Q9BSE2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms