Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC39A3Q9BRY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC39A3Q9BRY0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC39A3Q9BRY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC39A3Q9BRY0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC39A3Q9BRY0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC39A3Q9BRY0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms