Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP9

Putative uncharacterized protein MGC13053, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9BRP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9BRP9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9BRP9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9BRP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9BRP9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9BRP9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9BRP9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9BRP9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9BRP9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9BRP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9BRP9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9BRP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9BRP9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9BRP9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9BRP9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9BRP9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9BRP9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9BRP9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9BRP9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9BRP9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9BRP9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9BRP9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9BRP9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9BRP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9BRP9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9BRP9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9BRP9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9BRP9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9BRP9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9BRP9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9BRP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9BRP9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9BRP9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9BRP9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9BRP9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9BRP9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9BRP9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9BRP9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9BRP9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9BRP9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9BRP9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9BRP9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9BRP9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9BRP9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9BRP9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9BRP9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9BRP9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9BRP9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9BRP9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9BRP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9BRP9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9BRP9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9BRP9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9BRP9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9BRP9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9BRP9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9BRP9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9BRP9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9BRP9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9BRP9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9BRP9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9BRP9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9BRP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9BRP9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9BRP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9BRP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9BRP9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9BRP9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9BRP9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9BRP9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9BRP9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9BRP9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9BRP9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9BRP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9BRP9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9BRP9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9BRP9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9BRP9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9BRP9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9BRP9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9BRP9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9BRP9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9BRP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9BRP9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9BRP9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9BRP9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms