Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQT9

CLSTN3, Calsyntenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3Q9BQT9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN3Q9BQT9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CLSTN3Q9BQT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CLSTN3Q9BQT9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLSTN3Q9BQT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLSTN3Q9BQT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLSTN3Q9BQT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLSTN3Q9BQT9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLSTN3Q9BQT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CLSTN3Q9BQT9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLSTN3Q9BQT9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms