Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VGLL1Q99990 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VGLL1Q99990 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VGLL1Q99990 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VGLL1Q99990 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
VGLL1Q99990 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VGLL1Q99990 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms