Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHOX2BQ99453 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHOX2BQ99453 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHOX2BQ99453 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PHOX2BQ99453 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PHOX2BQ99453 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHOX2BQ99453 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHOX2BQ99453 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms