Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC6Q96SB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC6Q96SB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC6Q96SB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMC6Q96SB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMC6Q96SB8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMC6Q96SB8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms