Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DERL3Q96Q80 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DERL3Q96Q80 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DERL3Q96Q80 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DERL3Q96Q80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DERL3Q96Q80 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DERL3Q96Q80 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DERL3Q96Q80 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms