Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ALS2CR12Q96Q35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALS2CR12Q96Q35 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ALS2CR12Q96Q35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ALS2CR12Q96Q35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ALS2CR12Q96Q35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ALS2CR12Q96Q35 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ALS2CR12Q96Q35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms